Das Targeting ohne Cookies hat auch einige Nachteile gegenüber den Alternativen. Zum einen kann die Genauigkeit bei der Identifizierung von Zielgruppen geringer sein, da es auf Wahrscheinlichkeitsmodellen oder Kontextinformationen basiert, die nicht so genau sein können wie Cookies. Dies kann zu einer geringeren Wirksamkeit der Werbekampagnen führen. Andererseits könnten einige Werbetreibende weiterhin auf Cookies und andere Tracking-Methoden angewiesen sein, um bestimmte Marketingziele zu erreichen, insbesondere im Bereich der Retargeting-Kampagnen. Schließlich könnte die Umstellung auf Cookiesless Targeting zusätzliche Kosten für die Implementierung neuer Technologien und die Schulung von Mitarbeitern verursachen. Dennoch entwickelt sich Cookiesless Targeting weiter, um diesen Herausforderungen zu begegnen.